Protein–RNA interactions for Protein: Q9H741

C12orf49, UPF0454 protein C12orf49, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf49Q9H741 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C12orf49Q9H741 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C12orf49Q9H741 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms