Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms