Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TRIM4Q9C037 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms