Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PUS3Q9BZE2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PUS3Q9BZE2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms