Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
YTHDF1Q9BYJ9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
YTHDF1Q9BYJ9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms