Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCGF6Q9BYE7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCGF6Q9BYE7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms