Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SHANK3Q9BYB0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHANK3Q9BYB0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms