Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CARD11Q9BXL7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms