Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
REPIN1Q9BWE0 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms