Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
HIGD2AQ9BW72 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms