Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RIOK2Q9BVS4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms