Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RTKNQ9BST9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RTKNQ9BST9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms