Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYD88Q99836 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms