Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NUP88Q99567 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP88Q99567 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms