Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8L2Q96SF2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCT8L2Q96SF2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms