Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SORCS2Q96PQ0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SORCS2Q96PQ0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms