Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF48Q96MX3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF48Q96MX3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms