Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC43Q96MW1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC43Q96MW1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms