Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC7Q96M83 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC7Q96M83 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms