Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRRIQ1Q96JM4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRIQ1Q96JM4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRIQ1Q96JM4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
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