Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VPS50Q96JG6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VPS50Q96JG6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms