Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC137794.1-201ENST00000509185 914 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 LINC00976-203ENST00000630386 866 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A3Q96HJ5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms