Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LTV1Q96GA3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LTV1Q96GA3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms