Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RSPRY1Q96DX4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms