Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC11Q96DB2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC11Q96DB2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms