Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMIGD2Q96BF3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms