Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 DMKN-264ENST00000597212 638 ntTSL 314.77□□□□□ -0.054e-6■■■■■ 41.2
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TBRG4Q969Z0 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.564e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPFIBP2-222ENST00000532416 538 ntTSL 411.52□□□□□ -0.574e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 SAMHD1-201ENST00000262878 4784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.574e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PARD3B-202ENST00000351153 3411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.584e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPP6R3-220ENST00000530427 560 ntTSL 511.42□□□□□ -0.584e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PARD3B-201ENST00000349953 3315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DCAF5-202ENST00000389997 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 41.2
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TBRG4Q969Z0 JMJD8-211ENST00000568313 955 ntTSL 211.07□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-252ENST00000488762 691 ntTSL 311.07□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 AC020915.6-201ENST00000637233 3042 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 TBC1D23-208ENST00000486274 4054 ntTSL 510.98□□□□□ -0.654e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-222ENST00000462721 970 ntTSL 1 (best)10.96□□□□□ -0.654e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-257ENST00000493517 505 ntTSL 510.94□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 DMKN-242ENST00000476246 712 ntTSL 310.94□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPFIBP2-208ENST00000528883 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 41.2
TBRG4Q969Z0 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.664e-6■■■■■ 41.2
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TBRG4Q969Z0 PPP6R3-226ENST00000534534 2968 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.674e-6■■■■■ 41.2
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