Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CELF1Q92879 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF1Q92879 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms