Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HELBQ8NG08 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms