Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SPTSSBQ8NFR3 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms