Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APCDD1LQ8NCL9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APCDD1LQ8NCL9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms