Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTL3Q8N8U3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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