Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
NUP54Q7Z3B4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NUP54Q7Z3B4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms