Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTY1

SLC16A9, Monocarboxylate transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A9Q7RTY1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC16A9Q7RTY1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC16A9Q7RTY1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms