Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP43Q70EL4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms