Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEM1Q6ZVN7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEM1Q6ZVN7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms