Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FOXD4L3Q6VB84 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD4L3Q6VB84 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms