Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCBE1Q6UXH8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCBE1Q6UXH8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms