Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUX4L9Q6RFH8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms