Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EDC4Q6P2E9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EDC4Q6P2E9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms