Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
INTS3Q68E01 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
INTS3Q68E01 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms