Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG16L1Q676U5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L1Q676U5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms