Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GARNL3Q5VVW2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GARNL3Q5VVW2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms