Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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GFI1BQ5VTD9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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GFI1BQ5VTD9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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GFI1BQ5VTD9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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GFI1BQ5VTD9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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GFI1BQ5VTD9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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GFI1BQ5VTD9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
GFI1BQ5VTD9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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