Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STRIP1Q5VSL9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STRIP1Q5VSL9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms