Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SOGA3Q5TF21 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOGA3Q5TF21 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms