Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUP188Q5SRE5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP188Q5SRE5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms