Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PITRM1Q5JRX3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms