Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ODF2Q5BJF6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ODF2Q5BJF6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms