Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SDK2Q58EX2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms